באמצע המאה ה-19 פליקס בוטשקובסקי, פקיד בריאות רשמי מטעם הממשלה הפולנית, ערך מחקר שבדק את עובדי מכרות המלח. המחקר גילה כי עובדים שבילו פרק זמן משמעותי במכרות המלח, סבלו הרבה פחות אם בכלל, מבעיות נשימה. ב-1834 הוציא לאור בוטשקובסקי ספר אודות השפעתו החיובית של המלח. יורשו מסטיסלב פולדשקובסקי עשה שימוש במימצאי מחקרו בעת שבנה את מרפאת הספלאותרפיה הראשונה בעולם בכפר וילייאקו שבפרברי קרקאו.

מלחמת העולם השנייה סיפקה הוכחה נוספת לאילו שביקשו לבדוק את השיטה. במהלך המלחמה הפכו מכרות המלח שבמערב רוסיה למקלטים מוגנים בעומק של 300 מ' מתחת לאדמה מפני הפצצות האוויר של הצבא הגרמני. במהלך השהיה במכרות שמו לב חולי אסטמה ומחלות נשימתיות כי זו הקלה באופן משמעותי את הסימפטומים מהם סבלו.

ב-1968 הוקם בברית המועצות לשעבר בית החולים האזורי הראשון לאלרגיות שהכיר בספלאותרפיה  כשיטת טיפול רשמית. בית החולים נבנה במעבהו של מכרה המלח שבכפר סולוטבינו, קרפטיה.

עם נפילת הקומוניזם ושיפור מיומנויות התקשורת העולמיות יצאה הספלאותרפיה ממעבה האדמה, ואימצה לה סגנון פעולה מודרני. ההתפתחות הטכנולוגית איפשרה בניית סביבה התואמת את מכרות המלח הטבעיים במרפאות ספלאותרפיה שמעל הקרקע.

ברוך בקר יועץ הספלאותרפיה של Breathewell נמנה על חלוצי השיטה בישראל. בקר בעל הסמכה רשמית של אח המתמחה בבעיות נשימתיות, עלה ארצה מאוקראינה ב-1996. את חדר המלח הראשון שלו הקים בעיר חיפה בשנת 2000, ולאחריו הקים 15  קליניקות לספלאותרפיה בישראל. למידע נוסף בקרו באתר www.saltroom.co.il.